Collections françaises du figuier — INRAE, CIRAD, CBN Porquerolles

En bref. La France dispose d’un dispositif de conservation et recherche figuier structuré autour de plusieurs pôles complémentaires : (1) CIRAD-INRAE Montpellier (UMR AGAP — Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales), porté notamment par l’équipe de Bouchaib Khadari et Jean-Frédéric Terral — référence mondiale pour la caractérisation moléculaire SSR/SNP du germoplasme méditerranéen ; (2) Conservatoire Botanique National Méditerranéen de Porquerolles (CBNMP) à Hyères (Var), en lien avec la collection privée de 250+ variétés des Pépinières Baud de Vaison-la-Romaine (la collection propre du CBNMP en figuiers est plus restreinte — chiffre exact à préciser) ; (3) INRAE Bordeaux-Cestas et INRAE Sophia Antipolis (Institut Sophia Agrobiotech) pour certaines accessions de recherche. Pas de collection centralisée nationale à l’échelle USDA Davis, mais une densité scientifique francophone unique mondialement, reflétée par les publications continues du groupe Khadari-Terral-Roger depuis les années 2000.

1. Cadre institutionnel français

[ÉTABLI] La France ne dispose pas d’une collection nationale unique du type USDA NCGR Davis, mais d’un dispositif distribué entre plusieurs institutions complémentaires :

INRAE (Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement, anciennement INRA jusqu’en 2020).
CIRAD (Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement).
UMR AGAP-Institut : unité mixte de recherche Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales, regroupant CIRAD + INRAE + Institut Agro Montpellier.
CBN Méditerranéen de Porquerolles : Conservatoire Botanique National à statut associatif d’intérêt public.

[ÉTABLI] Cette architecture multi-pôles est l’héritage d’une culture scientifique française axée sur la recherche-conservation plutôt que sur la concentration centralisée à l’américaine.

2. Équipe Khadari-Terral — référence mondiale

[ÉTABLI] L’équipe scientifique CIRAD-INRAE Montpellier autour de Bouchaib Khadari est l’une des références mondiales pour la génétique moléculaire du figuier :

2.1 Trajectoire scientifique

[ÉTABLI] Bouchaib Khadari (CIRAD-AGAP-Institut Montpellier) et ses collaborateurs (Jean-Frédéric Terral, archéobotaniste ISEM-Montpellier ; Hafid Achtak et Mohammed Ater au Maroc ; Sylvain Santoni et Finn Kjellberg au CIRAD) ont publié depuis les années 2000 une série d’études fondatrices sur la diversité génétique méditerranéenne du figuier.

2.2 Études fondatrices

[ÉTABLI] Publications de référence du groupe Khadari :

Année	Référence	Apport
2003	Khadari B. et al. — Microsatellites in Ficus carica. Theoretical and Applied Genetics.	Premier set de marqueurs SSR pour le figuier
2005	Khadari B. et al. — Diversity génétique du figuier.	Premier inventaire méditerranéen
2009	Achtak H., Oukabli A., Ater M., Santoni S., Kjellberg F., Khadari B. — Microsatellite markers as reliable tools for fig cultivar identification. JASHS 134(6):624-631. DOI : 10.21273/JASHS.134.6.624	Protocole SSR international standardisé
2010	Achtak H., Ater M., Oukabli A., Santoni S., Kjellberg F., Khadari B. — Traditional agroecosystems as conservatories and incubators of cultivated plant varietal diversity: the case of fig (Ficus carica L.) in Morocco. BMC Plant Biology 10:28. DOI : 10.1186/1471-2229-10-28	Démonstration du rôle conservateur des agroécosystèmes traditionnels
2022	Aljane F. et al. — Genetic diversity of fig germplasm from the Mediterranean basin as revealed by SSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution. DOI : 10.1007/s10722-022-01509-0	Diversité étendue, structure des populations
2025	Exploring the genetic diversity of Mediterranean fig trees highlights genes associated with fruit traits. PMC : PMC12929547	Whole-genome resequencing sur 286 génotypes (Espagne, Turquie, Tunisie)

[ÉTABLI] Cette continuité de production scientifique sur plus de 20 ans fait de l’équipe Khadari-Terral la référence francophone mondiale pour le germoplasme méditerranéen du figuier.

3. Conservatoire Botanique National Méditerranéen de Porquerolles

[ÉTABLI] Le CBN Méditerranéen de Porquerolles (Hyères, Var) est l’institution patrimoniale française pour la conservation des variétés fruitières méditerranéennes, dont le figuier :

Statut : Conservatoire Botanique National à statut associatif d’intérêt public, sous tutelle Ministère de l’Environnement et de la Transition Écologique.
Mission : conservation ex situ et in situ des plantes sauvages et cultivées de la Méditerranée française.
Collection figuier : travaille en lien avec la collection privée des Pépinières Baud (Vaison-la-Romaine) de 250+ variétés caractérisées, l’une des plus diverses au monde ; [INCERTAIN] la collection propre du CBNMP en figuiers est plus restreinte que ce chiffre (cf. fiche Région Vaucluse).
Localisation : antenne de Hyères + sites annexes (Pépinière Baud Vaucluse pour la collection en place).

[ÉTABLI] Cette collaboration CBN + Pépinières Baud est un exemple unique mondialement de partenariat institution-pépiniériste pour la conservation des cultivars patrimoniaux.

4. INRAE Bordeaux-Cestas et Sophia Antipolis

[ÉTABLI] Deux autres pôles INRAE participent indirectement à la conservation figuière :

4.1 INRAE Bordeaux-Cestas

[ÉTABLI] Le centre INRAE Bordeaux-Aquitaine (site de Cestas) maintient certaines accessions de recherche sur le figuier dans le cadre de programmes spécifiques, en lien avec les terroirs du Sud-Ouest français (jardin de Cestas, expérimentations de bouturage et d’adaptation climatique).

[INCERTAIN] Le volume précis d’accessions figuier à Cestas n’est pas publiquement communiqué — pour la chasse historique, c’est un site de recherche actif mais pas un centre de conservation patrimoniale au sens strict.

4.2 INRAE Sophia Antipolis — Institut Sophia Agrobiotech (ISA)

[ÉTABLI] L’Institut Sophia Agrobiotech (UMR INRAE + Université Côte d’Azur + CNRS) à Sophia Antipolis (Alpes-Maritimes) :

Mission principale : recherche en agrobiotech sur l’adaptation des plantes, la résistance aux stress biotiques et abiotiques, l’interaction plante-insecte.
Implication figuier : recherche connexe sur la résistance aux ravageurs et la caractérisation morphologique d’accessions méditerranéennes.
Lien avec le CBN Porquerolles : proximité géographique facilitant les collaborations.

5. Articulation avec le système ECPGR-AEGIS-EURISCO

[ÉTABLI] Les collections françaises sont partiellement déclarées dans le système européen ECPGR :

Référencement EURISCO : certaines accessions de la collection Baud-CBNMP et des accessions INRAE/CIRAD sont visibles dans la base EURISCO européenne.
AEGIS : participation française à la virtual genebank européenne pour certaines accessions désignées MAA (Most Appropriate Accessions).
Coordination scientifique : Bouchaib Khadari et son équipe interviennent comme experts auprès de Bioversity International et ECPGR pour les questions figuières.

[PROBABLE] La création d’un ECPGR Fig Working Group (qui n’existe pas au moment de la rédaction) bénéficierait directement à la coordination des collections françaises avec les autres pays européens.

6. Accès au matériel et aux données

[ÉTABLI] Modalités d’accès :

Échanges intra-recherche académique : matériel partagé entre équipes universitaires sous conventions bilatérales et SMTA (Standard Material Transfer Agreement).
Distribution amateur : moins ouverte que la collection USDA Davis. Les Pépinières Baud restent le canal principal pour les amateurs souhaitant accéder à la diversité variétale conservée au CBNMP (catalogue commercial annuel, ~50 000 plants/an, cf. fiche Région Vaucluse).
Publications scientifiques : disponibles via HAL.science (archive ouverte française), ResearchGate, DOI des journaux internationaux.

7. Importance pour Figgipedia

[ÉTABLI] Les collections françaises sont une source d’autorité scientifique majeure pour Figgipedia :

Source méditerranéenne de référence : caractérisation SSR de la diversité méditerranéenne occidentale (France, Espagne, Maroc, Algérie, Tunisie).
Continuité francophone : publications en français disponibles, ce qui facilite l’intégration dans la doctrine pyramide Figgipedia.
Niveau pyramide : les variétés référencées dans les collections françaises sont niveau 2 minimum (collection officielle reconnue), parfois niveau 1 si caractérisées moléculairement par SSR (école Khadari).
Sources bibliographiques : articles Khadari, Aljane, Achtak servent de référence dans plusieurs fiches Figgipedia (cf. fiches variétés méditerranéennes et fiches régions).

8. Perspectives 2026-2030

[PROBABLE] Trois axes :

Centralisation possible des collections fruitières françaises : tendance récente vers une convergence des collections INRAE / CIRAD sous l’égide de l’UMR AGAP-Institut Montpellier.
Pan-génome méditerranéen : l’équipe Khadari-Terral est positionnée pour contribuer significativement à un pan-génome consensus mondial via les 286 génotypes séquencés en 2025 (Espagne + Turquie + Tunisie).
Émergence d’un Working Group Ficus ECPGR : la France serait un acteur naturel de cette démarche si elle se concrétise.

Voir aussi

Sources

INRAE / CIRAD — UMR AGAP-Institut (Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales). URL : umr-agap-institut.cirad.fr
Institut Sophia Agrobiotech (INRAE) — Site officiel. URL : institut-sophia-agrobiotech.paca.hub.inrae.fr
Achtak H., Oukabli A., Ater M., Santoni S., Kjellberg F., Khadari B. (2009) — Microsatellite markers as reliable tools for fig cultivar identification. JASHS 134(6):624-631. DOI : 10.21273/JASHS.134.6.624
Achtak H., Ater M., Oukabli A., Santoni S., Kjellberg F., Khadari B. (2010) — Traditional agroecosystems as conservatories and incubators of cultivated plant varietal diversity: the case of fig (Ficus carica L.) in Morocco. BMC Plant Biology 10:28. DOI : 10.1186/1471-2229-10-28
Aljane F. et al. (2022) — Genetic diversity of fig (Ficus carica L.) germplasm from the Mediterranean basin as revealed by SSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution. DOI : 10.1007/s10722-022-01509-0
Conservatoire Botanique National Méditerranéen de Porquerolles — Collection de variétés fruitières méditerranéennes. URL : www.cbnmed.fr