Collection USDA NCGR Davis (Wolfskill Orchard) — référence mondiale

En bref. Le National Clonal Germplasm Repository for Tree Fruit and Nut Crops de Davis, Californie est la collection institutionnelle de référence mondiale pour Ficus carica. Géré par l’USDA-ARS (US Department of Agriculture, Agricultural Research Service) sur les Wolfskill Experimental Orchards (Winters, Yolo County, CA), il maintient 190 accessions de figuier réparties en : 78 cultivars fruitiers nommés, 44 sélections régionales (origines diverses), 40 sélections avancées (programmes de breeding), 28 caprifigs, et un petit nombre d’espèces et hybrides. Héritage des travaux fondateurs d’Ira J. Condit (1883-1981) et W. B. Storey, dont les caprifigs persistents uniques au monde (UCR 228-20, 271-1, 347). Données accessibles publiquement via GRIN-Global (npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/search.aspx). Distribution gratuite du matériel (scionwood / boutures dormantes) aux chercheurs internationaux sur demande. Référence pomologique : Stover & Ferguson (2010) ; mise à jour SSR : Ferguson, Stover et al. (2022) dans PLOS ONE (DOI 10.1371/journal.pone.0263715).

1. Cadre institutionnel

[ÉTABLI] Le NCGR Davis s’intègre dans le National Plant Germplasm System (NPGS) des États-Unis :

• Tutelle : USDA-ARS (USDA Agricultural Research Service), service de recherche agronomique du Department of Agriculture américain.
• Localisation administrative : University of California, Davis (Department of Plant Sciences) en partenariat opérationnel depuis 1980 (bail de long terme avec UC Davis).
• Localisation physique des vergers : Wolfskill Experimental Orchards, Winters, Yolo County, Californie (~15 miles à l’ouest de Davis).
• Mission : acquérir, maintenir, distribuer, évaluer et documenter les collections nationales de fruits et noix méditerranéens.

[ÉTABLI] Le NCGR Davis curé les collections nationales des 14 cultures fruits et noix méditerranéens suivantes : almond, apricot, cherry, fig, grape, kiwifruit, mulberry, olive, peach, persimmon, pistachio, plum, pomegranate, walnut.

2. Collection figuier — 190 accessions documentées

[ÉTABLI] Le NCGR Davis maintient actuellement 190 accessions distinctes de Ficus carica (chiffre confirmé par USDA-ARS 2024) :

[ÉTABLI] Toutes les accessions sont accessibles via la base GRIN-Global (Germplasm Resources Information Network), avec interface publique de recherche en ligne.

3. Histoire — héritage Condit et Storey

[ÉTABLI] Le NCGR Davis est l’héritier scientifique direct des travaux d’Ira J. Condit (1883-1981) et de W. B. Storey :

• Ira Condit : professeur à UC Riverside puis UC Davis (~1920-1970), auteur des deux monographies mondiales de référence sur le figuier — The Fig (Chronica Botanica, 1947) et Fig varieties: a monograph (Hilgardia 23(11):323-538, 1955). Importateur et descripteur de centaines de cultivars du monde entier.
• W. B. Storey : successeur de Condit à UC Riverside, amorce les programmes de breeding planifiés aboutissant à Conadria (premier cultivar fig issu d’un programme structuré).
• 1980 : intégration formelle des collections universitaires UC dans le système USDA-ARS via bail de long terme sur Wolfskill.

[ÉTABLI] Cette continuité historique multi-générationnelle (Condit 1920s → Storey 1950s-70s → USDA-ARS depuis 1980 → curators contemporains) est unique au monde et a permis l’accumulation patrimoniale exceptionnelle de la collection actuelle.

4. Caprifigs persistents — innovation unique au monde

[ÉTABLI] Une contribution majeure de la collection NCGR Davis est sa série de caprifigs persistents, fruit du travail Condit-Storey :

• Trois accessions particulièrement précieuses : UCR 228-20, UCR 271-1, UCR 347.
• Origine du trait : ancienne sélection française « Croisic » (caprifig persistent ancestral européen).
• Méthodologie : 3 à 5 générations de rétro-croisements avec des cultivars femelles de haute qualité fruitière.
• Intérêt agronomique : caprifigs qui persistent sur l’arbre plus longtemps, facilitant la logistique de la caprification industrielle dans les vergers Calimyrna/Sari Lop (cf. fiche Région Aydın).

[ÉTABLI] Ces caprifigs persistents sont uniques au monde et constituent une ressource génétique stratégique pour tous les programmes de breeding internationaux travaillant sur les variétés Smyrne et San Pedro.

5. Accès aux données — GRIN-Global

[ÉTABLI] La base de données GRIN-Global est l’outil documentaire central :

• URL : npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/search.aspx
• Interface publique : recherche par taxon, accession, origine géographique, descripteur morphologique.
• Données par accession : nom (DFIC), origine, donateur, statut conservé, photo (partielle), descripteurs morphologiques, historique des distributions, références bibliographiques associées.
• Format d’identifiant : DFIC (Davis Fig Collection) suivi d’un numéro (par exemple DFIC 92 = Stanford Smyrna, DFIC 134 = Stanford Caprifig).

[ÉTABLI] Les variétés référencées DFIC constituent une source de référence taxonomique mondialement reconnue, citée dans les publications scientifiques sur le figuier.

6. Distribution du matériel

[ÉTABLI] Politique de distribution :

• Gratuité : il est de la politique NPGS de distribuer le matériel végétal gratuitement aux intérêts de recherche dans le monde entier.
• Forme distribuée : scionwood (boutures dormantes hivernales), typiquement 2-4 boutures par accession par demande.
• Procédure : demande via le portail GRIN-Global, validation par le curator, expédition saisonnière (généralement décembre-février pour l’hémisphère nord).
• Public visé : prioritairement la recherche académique ; les demandes amateur sont parfois acceptées mais soumises à examen au cas par cas.
• Cadre juridique : matériel distribué avec passeport phytosanitaire USA, sous certaines restrictions d’export (l’importateur doit obtenir un permis d’importation phytosanitaire auprès de son service national).

7. Re-évaluation moléculaire 2022 — Ferguson et al. PLOS ONE

[ÉTABLI] Une mise à jour moléculaire majeure de la collection a été publiée en 2022 :

• Ferguson L., Stover E. et al. (2022) — Re-evaluation of NCGR Davis Ficus carica and palmata SSR profiles. PLOS ONE. DOI : 10.1371/journal.pone.0263715. PMC : PMC8820598.
• Apports : caractérisation SSR systématique de la collection, résolution de synonymies et homonymies historiques, identification des accessions véritablement distinctes, comparaison avec collections internationales (Italie, Slovénie, Espagne).
• Référence pour les programmes de breeding : permet d’éviter les doublons cachés lors des sélections de croisements.

[ÉTABLI] Études connexes : Podgornik et al. (2018) sur DNA profiling Slovénie + USDA Californie ; Stover & Ferguson (2010) sur les ressources génétiques du NCGR Davis.

8. Importance pour Figgipedia

[ÉTABLI] La collection NCGR Davis est l’une des sources de référence taxonomique les plus utilisées pour Figgipedia :

• Variétés DFIC référencées dans le vault Figgipedia (Stanford Smyrna DFIC 92, Stanford Caprifig DFIC 134, etc.).
• Résolution de synonymies : la caractérisation SSR Ferguson 2022 permet de trancher entre noms multiples pour une même accession génétique.
• Niveau pyramide : les variétés référencées NCGR Davis sont niveau 2 minimum dans la doctrine Figgipedia (équivalent collection officielle référencée).
• Continuité avec Condit 1947 et 1955 : la collection est l’héritière directe de la description morphologique de référence mondiale.

9. Perspectives 2026-2030

[PROBABLE] Trois axes :

1. Séquençage whole-genome d’accessions prioritaires de la collection, contribution potentielle au pan-génome consensus mondial (cf. fiche Pan-génomique).
2. Pression budgétaire : maintien du financement public USDA-ARS face aux restrictions budgétaires fédérales américaines récurrentes.
3. Diffusion internationale : maintien et extension du rôle de source mondiale de matériel de breeding pour les programmes au Japon, en Italie, en France, au Maroc, en Tunisie et en Iran.

Voir aussi

• Région Californie / Wolfskill Experimental Orchards
• Collection ECPGR
• Collection INRAE Bordeaux-Sophia
• OurFigs et FigBid — communauté collector
• Pan-génomique de Ficus carica
• Marqueurs SSR figuier

Sources

1. USDA-ARS — NCGR Davis Fig page. URL : www.ars.usda.gov/pacific-west-area/davis-ca/natl-clonal-germplasm-rep-tree-fruit-nut-crops-grapes/docs/fig-page/main/
2. USDA — GRIN-Global database. URL : npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/search.aspx
3. Stover E., Ferguson L. (2010) — Fig genetic resources and research at the US National Clonal Germplasm Repository in Davis, California. Acta Horticulturae ; ResearchGate : 43274222
4. Ferguson L., Stover E., Crisosto C.H. et al. (2022) — Re-evaluation of NCGR Davis Ficus carica and palmata SSR profiles. PLOS ONE. DOI : 10.1371/journal.pone.0263715 (PMC : PMC8820598)
5. Podgornik M. et al. (2018) — DNA profiling of figs from Slovenia and Californian USDA collection revealed the uniqueness of some North Adriatic varieties. ResearchGate : 324278214
6. Condit I.J. (1947) — The Fig. Chronica Botanica Company, Waltham. (Archive Internet : archive.org/stream/ConditI.J.TheFig)
7. Condit I.J. (1955) — Fig varieties: a monograph. Hilgardia 23(11):323-538. (Source d’autorité référentielle Figgipedia.)